Das Zahlenrätsel Jelly Links fordert Sie heraus, in jedem Level Verbindungen zwischen den Jelly-Buttons herzustellen. Einige Schaltflächen sind mit Nummern versehen, während die übrigen grau mit einem Fragezeichen versehen sind. Sie müssen auf die grauen Elemente klicken, um eine Zahl basierend auf den Spielregeln auszuwählen. Darin heißt es, dass in einer Zeile oder Spalte keine zwei identischen Zahlen stehen dürfen. Sie können nur die Zahlen auf den grauen Schaltflächen ändern, der Rest ist festgelegt und kann in Jelly Links nicht geändert werden. Die Level im Spiel werden nach und nach schwieriger, die Spielfeldfläche wird größer und es wird mehr Schaltflächen geben.