In der Pixelwelt begann das Ende der Welt. Es ist nicht bekannt, woher die Horden lebender Toten kamen, die jetzt kleine Städte angreifen und Menschen töten und in ähnliche verwandeln. Aber es gab tapfere Menschen auf der Welt, die sich zur Verteidigung ihrer Siedlungen bewaffnet hatten. Sie im Spiel Pixel Shot werden einer von ihnen sein. Ihr Charakter muss durch die Straßen der Stadt laufen und alle Zombies finden. Mit Hilfe seiner mächtigen Waffen kann er alle Monster zerstören. Auf dem Weg wird er verschiedene Gegenstände sammeln müssen, die ihm beim Kampf gegen die lebenden Toten helfen.