Der Ninja muss im Spiel Running Ninja eine sehr schwierige Mission erfüllen. Der böse Magier hat den ganzen Bezirk in Schrecken versetzt. Nachdem er einen sehr mächtigen Zauber erhalten hatte, fühlte sich der Zauberer wie der König der Welt. Oben auf dem Turm seines Schlosses installierte er mächtige magische Waffen. Es erzeugt böse kleine Kreaturen, die alles auf ihrem Weg zerstören. Der Ninja ist der einzige, der sich entschlossen hat, sich dem Zauberer zu stellen. Er hat einen Vorteil gegenüber anderen Soldaten und es liegt in der Tatsache, dass der Held weiß, wie man sich sehr schnell bewegt. Dies hat jedoch auch seine negative Seite. Bei dieser Geschwindigkeit ist es schwierig, auf Hindernisse zu reagieren. Hilf dem Charakter, Hindernisse zu überwinden.