Im Seekönigreich brach ein Krieg zwischen den beiden Thronprätendenten aus. Im Zuge der Feindseligkeiten setzen beide Seiten speziell ausgebildete Kampffischabteilungen ein. Im Spiel BattleFish schließen Sie sich einer der Gruppen an und befehligen einen der Fischtrupps. Ein bestimmter Ort, der sich unter Wasser befindet, wird auf dem Bildschirm vor Ihnen sichtbar. Auf der einen Seite befindet sich Ihr Kampffisch und auf der anderen Seite der Feind. Unten befindet sich ein spezielles Bedienfeld mit Symbolen. Mit ihrer Hilfe lenkst du die Aktionen deines Trupps. Sie müssen den feindlichen Fisch sorgfältig untersuchen und Ihr Ziel auswählen, um ihn anzugreifen. Ihre Fische werden gemeinsam den Feind schlagen und zerstören. Dafür erhalten Sie Punkte.