Im Mittelalter fanden zwischen vielen Staaten auf den Meeren erbitterte Schiffskämpfe statt. Im Spiel Ships 3D nehmen Sie als Kapitän des Schiffes an diesen Schlachten teil. Vor Ihnen auf dem Bildschirm wird Ihr Schiff sichtbar sein, das auf dem Meer segeln wird. Anhand der Karte müssen Sie nach feindlichen Schiffen suchen. Wenn Sie sie gefunden haben, werden Sie in einer bestimmten Entfernung mit ihnen zusammenlaufen. Danach zielen Sie auf feindliche Schiffe und eröffnen das Feuer von Kanonen. Wenn Sie genau sehen, werden Ihre Kerne die feindlichen Schiffe treffen, Löcher in ihnen verursachen und sie werden sinken. Für jedes zerstörte Schiff erhalten Sie Punkte im Spiel Ships 3D. Sie werden auch beschossen. Sie müssen Ihr Schiff manövrieren, damit es schwerer zu treffen ist.