Der Ninja hat lange studiert und endlich ist es an der Zeit, sein Wissen und seine Fähigkeiten in Dark Ninja Hanjo einzusetzen. Sensei teilte seinem Schüler mit, dass er bereit sei, ein unabhängiges Leben zu beginnen, doch gleichzeitig wurde der ehemalige Schüler gebeten, eine sehr wichtige Mission zur Wiederherstellung der Stadt durchzuführen. Die Mission wird zeigen, wie gut der Held vorbereitet ist. Die Stadt wird von der Dunkelheit verzehrt; um sie zu befreien, müssen Sie gegen Dämonen oder besessene Krieger kämpfen. Der Ninja wird zeigen können, wozu er fähig ist. Erhalten Sie Anweisungen vom Lehrer; in der Anfangsphase wird er seinen Schüler begleiten, aber dann müssen Sie in Dark Ninja Hanjo alleine handeln.
