Ein düsterer Himmel mit hängenden Wolken in einer seltsamen Farbe, überall Pfützen grüner, verdächtig riechender Flüssigkeit, heruntergekommene Gebäude und kaputte Autos – das ist alles, was von der einst aktiven Basis in Toxic Arena: Biological Threat übrig geblieben ist. Es stellt sich heraus, dass auf seinem Territorium geheime Experimente zur menschlichen Mutation durchgeführt wurden. Als es zu der Explosion kam, wurde das Gebiet kontaminiert und Mutanten brachen an die Oberfläche. Um die Bedrohung zu lokalisieren und zu verhindern, dass sich die Monster im gesamten Gebiet ausbreiten, wurde der Held geschickt, um sie in „Toxic Arena: Biological Threat“ zu eliminieren.