Das Maulwurfskönigreich existierte friedlich am Rande des Waldes und störte niemanden, aber irgendwann in der Verteidigung des Maulwurfskönigreichs musste er sich in den Beschützer des gesamten Waldes verwandeln, da das Königreich an der Grenze liegt. Das friedliche Leben endete, als der Wald von fliegenden, kriechenden und rennenden Monstern angegriffen wurde. Der Maulwurfs-Grenzschutzbeamte hat den ersten Schlag abbekommen, aber bald werden Sie einen Magier, einen Bogenschützen und einen Speerkämpfer zu seiner Hilfe bringen. Sie werden ihre Grenzen verteidigen und den Feind nicht durchlassen. Die Auswahl der Upgrades während des Kampfes hängt von Ihnen ab. Am Ende jeder Angriffswelle erscheint ein Boss, der in Mole Kingdom Defense nicht leicht zu zerstören ist.