Im zweiten Teil des Spiels Counter Craft 2 nehmen Sie weiterhin an Feindseligkeiten zwischen verschiedenen Fraktionen teil, die in der Minecraft-Welt stattfinden. Zu Beginn des Spiels befinden Sie sich am Startort, wo Sie eine Waffe Ihrer Wahl auswählen können. Danach werden Sie zu einem bestimmten Ort transportiert. Sie müssen den Charakter geschickt kontrollieren und heimlich vorankommen. Verwenden Sie dazu die Merkmale des Reliefs, der Gebäude und verschiedener Objekte, die überall verstreut sind. Sobald Sie den Feind bemerken, richten Sie Ihre Waffe auf ihn und eröffnen Sie das Feuer, um ihn zu töten. Indem Sie genau schießen, zerstören Sie den Feind und erhalten Punkte dafür. Nach dem Tod des Feindes müssen Sie die Trophäen aufheben, die von ihm fallen werden.