In Outbreak Ops hat eine Epidemie Städte und Gemeinden heimgesucht. Es wurden Quarantänezonen eingerichtet, um auf die Ankunft eines Impfstoffs zu warten, doch die Zahl der Infizierten stieg und der Impfstoff begann zu mutieren. Kein Impfstoff kann den Mutanten wieder in die menschliche Form zurückbringen, daher wurde beschlossen, eine Säuberung der Quarantänezonen durchzuführen. Ihr Held wird Aufgaben erledigen und Sie werden ihm helfen. Seine Mission wird zum Überleben werden, weil es in Outbreak Ops zu viele Mutanten gibt. Sie müssen sich schnell bewegen, um nicht umzingelt zu werden.