Über einer Kolonie von Erdlingen, die sich auf einem der Planeten befindet, erschienen seltsame bunte Blasen. Wie sich herausstellte, sind sie mit Gift gefüllt. Allmählich steigen sie auf die Kolonie der Erdbewohner herab. Im Spiel Bubble Planets musst du sie alle zerstören. Dazu verwenden Sie eine spezielle Kanone. Sie wird einzelne Ladungen schießen, die auch eine bestimmte Farbe haben. Sie müssen alle Blasen sorgfältig untersuchen und einen Ort finden, an dem bestimmte Objekte gruppiert sind. Sie sollten die gleiche Farbe wie Ihre Ladung haben. Danach werden Sie einen Schuss abfeuern. Der Kern, der auf eine Gruppe von Objekten trifft, explodiert und Sie erhalten dafür eine bestimmte Anzahl von Punkten. Ihre Aufgabe ist es, das Spielfeld durch Ausführen dieser Aktionen so schnell wie möglich von allen Blasen zu befreien.