Der Ninja beschloss, seine Beine zu vertreten und durch die Stadt zu rennen und Münzen zu sammeln. Im Spiel Ninja Runner triffst du einen Helden und hilfst ihm, einen Parkour in der Stadt zu organisieren. Es gibt keine unüberwindbaren Höhen für den Helden, Sie können mehrmals auf den Kerl klicken und er springt auf jeden Gipfel: eine Plattform, einen Turm und einen anderen Gipfel. Nachdem Sie das Level durchlaufen haben, können Sie zu einem anderen wechseln, aber seien Sie vorsichtig, auf neuen Levels gibt es zusätzliche Hindernisse in Form von scharfen Stacheln, auf die Sie nicht springen müssen, um das Lebensherz nicht zu verlieren. Es gibt immer mehr scharfe Hindernisse, was bedeutet, dass Sie sehr schnell und agil sein müssen, um den Ninja vor dem Verlust des Lebens in Ninja Runner zu retten.