Während der Existenz der Menschheit hat sie immer gekämpft, die Kriege waren entweder in der heißen Phase oder in der kalten Phase, aber sie hörten nicht auf. Zur Verteidigung wurden verschiedene Bauwerke errichtet, darunter Festungen, von denen einige für besondere Anlässe geheim waren. Der Held des Spiels Secret Fort Escape blieb in einer dieser Festungen stecken. Er war es, der sich mit der Suche und Erforschung solcher Gebäude beschäftigte und es als großen Erfolg ansah, eine der geheimsten Festungen gefunden zu haben. Aber sein Fehler war, dass er alleine und ohne Begleitung dorthin ging. Infolgedessen hat er sich verirrt und Sie müssen ihn nun in den Geheimgängen der Festung in Secret Fort Escape finden.