Der Miniatur-Pixelheld nimmt Micro Metroid mit auf eine Reise durch eine Mikroplattform-Welt im Metrovania-Stil. Helfen Sie ihm, gefährliche Bereiche auf den Plattformen zu passieren, dann werden sie nur noch zahlreicher. Achten Sie auf die Zahnräder und wählen Sie Orte aus, an denen Sie auf die Plattform springen und weitergehen können. Unterwegs wird es Flaggen geben – das sind Kontrollpunkte, die Ihnen einen Ort bieten, an den der Held zurückkehrt, wenn er in Micro Metroid auf Stacheln gerät oder von einer Plattform fällt.